清理河道的工作主要由 水利部门负责。具体来说，河道清理是水利部门的重要职责之一，旨在维护水环境、保障生态安全和防止洪涝灾害。水利部门不仅拥有管理权和监督职责，还需制定科学规划、合理安排清理工作，并动员社会力量参与。
河道主管机关负责提出清障计划和实施方案，并对河道管理范围内的阻水障碍物进行清理，确保河道畅通。在紧急情况下，防汛指挥部会组织力量进行紧急清理。
此外，各级水行政主管部门和流域管理机构也在河道清理中扮演重要角色，需全面落实河道属地管理责任，推进河道管理范围内妨碍行洪突出问题的清理整治。
综上所述，清理河道的工作由水利部门负责，具体执行由河道主管机关和相关机构承担。建议进一步明确了各级责任主体，确保河道清理工作的高效实施。
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