港口码头通常归 中央交通部或地方港口行政管理部门管理。具体来说，交通部负责全国港口建设的行业管理工作，并具体负责经国家发展和改革委员会审批、核准和经交通部审批的港口建设项目的建设管理工作。省级交通主管部门负责本行政区域内港口建设的行业管理工作，并具体负责经省级人民政府有关部门审批、核准的港口建设项目的建设管理工作。其余港口建设项目的建设管理工作由港口所在地港口行政管理部门负责。
此外，港口码头也可以归属于“现代服务业当中的物流辅助业”，并且在国民经济行业分类中，中国港口码头行业主要归属于“交通运输、仓储和邮政业”这一大类，具体可能划分到“水上运输业”或“港口业”等子类别。
综上所述，港口码头的管理部门可以是中央交通部、省级交通主管部门或港口所在地的港口行政管理部门，具体归属需要根据港口的地理位置和管理层级来确定。
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